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En la zona del distrito de Puinahua la temperatura mensual en promedio es de 26.4°C con pequeñas fluctuaciones durante el año, principalmente en junio, donde por efectos del fenómeno denominado “friaje” que viene del sur, la temperatura baja a 18°C ; después de estos casos excepcionales, la temperatura diaria en promedio es de 29.9°C. En cuanto al clima de esta zona, la precipitación anual promedio es de 2,687mm con variaciones anuales en el rango de 1,800 – 4,000mm aproximadamente. No se observa estaciones secas o lluviosas pronunciadas, aunque los meses de julio a octubre normalmente son menos lluviosos que los meses de noviembre a Mayo.
Sabemos que las características de la vegetación son controladas por diferentes factores ambientales, como clima, hidrología y contenido de nutrientes de suelo. Las áreas negruzcas representan espejos de agua y las áreas blancas o amarillas representan vegetación baja (purmas, chacras y vegetación a lo largo de los ríos). Asumiendo que la zona no es un área uniforme, sino que tiene características ecológicamente diversas y aspectos distintos de vegetación y flora, debemos concluir que el uso de la tierra presenta también potencialidades diferentes, por lo que para facilitar un desarrollo sostenible en la zona, es necesario respetar este tipo de variaciones. Comprendiendo esta realidad, en la zona se ha creado la Reserva Pacaya y Samiria.
Con relación a la actividad eólica los datos sobre vientos indican la predominancia de dos direcciones SE (sureste) y SO (suroeste) con velocidades que alcanzan 6m/seg. Como máximo. Sin embargo, es necesario indicar que la rosa de vientos anual es complicada porque existen vientos en todas las direcciones y en magnitudes menores a 5m/seg. Incluyendo periodos de calma en los meses de Setiembre al parecer la predominancia de los vientos es NO (noroeste) y S (sur) (IIAP, 1991).
Finalmente es importante señalar que existen otros recursos naturales susceptibles de ser aprovechados industrialmente, tales como la arena. Las minas de arena, por su alto contenido en sílice, presentan cualidades excepcionales para la producción de vidrio o cristal.
En cuanto a los tipos de aguas presentes en la zona, en el río Puinahua el agua es turbia y agua oscura en la zona del Pacaya, cochas y algunas quebradas.
El distrito de Puinahua, pertenece al denominado “Llano Amazónico”, distinguiéndose tipos de terreno como el aluvial y colinoso, donde se identifican playas, orillares y colinas bajas. De acuerdo a la clasificación del geógrafo Javier Pulgar Vidal el distrito de Emilio San Martín se encuentra entre las siguientes regiones:
Sub-región de Restingas, Tahuampas y Bajos, de 80 a 120 msnm, comprendiendo la parte más baja.
Sub-región de Alturas, de 120 a 180 msnm., conformado por terrazas y colinas bajas inundables con las grandes crecientes de los ríos.
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